测试结果显示，湿筷子的霉菌比干筷子多25%以上。霉菌在湿度80%的条件下（如南方地区的梅雨季节）极易生长，而在湿度40%的条件下基本不生长。温度对霉菌生长的影响不大。
另外，使用时间超过6个月的筷子更容易长霉，霉菌数量比新筷子和使用3个月的筷子要多30%以上。
木质和竹质筷子结构疏松，表面的凹槽、细纹容易藏匿细菌。竹木筷的霉菌计数是不锈钢、合金、密胺筷的7倍以上。
测试结果还显示，酒精对霉菌基本没有作用；微波炉虽然消毒时间最短（3分钟），但只能用于合金筷；五类筷子都可通过高压锅、沸水、臭氧消毒柜来消毒，只是所用消毒时间略有差异。
值得注意的是，“用沸水烫一下筷子”的做法基本没用，只有当消毒时间超过20分钟，筷子上的菌落和霉菌才能被有效去除。五类筷子中，不锈钢、合金、密胺筷更易消毒，木筷、竹筷稍差。
上海市消保委提醒，筷子存放要注意保持环境干燥。筷子在湿度大时极易发霉，建议在湿度大的环境下，如梅雨季，最好能用除湿机降低室内空气湿度以防止发霉。
筷子最好每周进行一次消毒，养成勤换筷子的习惯，最好半年换一次。